Sono passati 18 mesi dal Giorno 4: Jack Bauer, costretto a fingersi morto per sfuggire alla rappresaglia del governo cinese per l’uccisione del loro console, si fa ora chiamare Frank e lavora in incognito come operaio nei pozzi di petrolio a Mojave, in California.
Si è fatto una nuova vita; vive in affitto a casa di Diane, una donna con cui sta nascendo una reciproca simpatia, osteggiata però dal figlio di lei, Derek, che nutre preoccupazioni riguardo l’oscuro passato di “Frank”, e lo interroga spesso per spingerlo a contraddirsi.
Solo 4 persone sanno che lui è ancora vivo; una di queste è l’ex presidente David Palmer, che proprio quel giorno si trova a Los Angeles, a casa del fratello Wayne, per portare avanti la stesura delle propria biografia. Palmer si mostra piuttosto teso, preoccupato: mentre si affaccia alla finestra, un cecchino gli spara e lo uccide.
Tony Almeida e Michelle Dessler hanno lasciato il CTU ma, appena saputa la notizia dell’assassinio di Palmer, Michelle decide di andare a dare una mano ai vecchi colleghi, nonostante Tony non approvi… Michelle avvia la macchina ma questa esplode: lei muore sul colpo, Tony è gravemente ferito.
Chloe O’Brien, l’ultima persona rimasta in vita fra quelle che conoscono il segreto di Jack, si rende ben presto conto che il collegamento fra questi attentati è proprio Jack Bauer, ovvero capisce che vogliono uccidere chi sa che lui è ancora vivo; Chloe riesce però a seminare i killer che la vogliono morta e chiede aiuto proprio a Jack, che si ritrova così costretto a ritornare a Los Angeles per salvare la sua amica.
Nel frattempo al CTU, dove ancora sono convinti del fatto che Bauer sia morto un anno e mezzo prima, arriva un filmato in cui si vede proprio Jack entrare nel palazzo da dove è stato esploso il colpo che ha assassinato Palmer, quindi l’obiettivo prioritario del CTU diventa arrestare Jack Bauer.
Nel contempo, nella sua residenza californiana, il presidente Charles Logan attende il presidente della Federazione Russa Yuri Suvarov per firmare uno storico trattato anti-terrorismo, che consentirà un reciproco scambio di mezzi e informazioni nella lotta contro le organizzazioni terroristiche…
